衡東縣醫療保障局是縣政府工作部門，為正科級。負責全縣基本醫療保險、大病保險、醫療救助經辦服務和監督管理，醫藥和醫療服務價格管理，藥品集中采購等工作。設辦公室、黨務辦、政工人事股、計劃財務股（與中心財務股合署辦公）、政策法規股（與中心定點協議服務股合署辦公、加掛優化營商環境辦公室）、待遇保障股（與中心特殊人群服務股合署辦公、加掛鄉村振興辦公室）、醫藥和醫療服務價格管理股、基金監管股等8個內設股室。局屬單位兩個即："醫療保障事務中心"（副科級）、"醫保基金監管中心"（正股級）。